Özel eğitim kurumunda ders programı; öğrencinin aylık ders hakkını (8 bireysel + 4 grup), eğitmenin günlük seans sınırını, sınıf kontenjanını, okul saatlerini ve resmî tatilleri aynı anda gözeterek kurulur. Program MEBBİS iş takvimine işlenir; her planlanan ders bir PKT üretir ve ay sonunda bildirime dönüşür.
Elle (Excel/kâğıt) kurulan programlarda en sık sorun çakışmadır: aynı eğitmen iki odada, aynı öğrenci iki derste ya da aynı odada iki grup. Çakışan ders MEBBİS’e girilemez.